兩年前，天才外科醫(yī)生“巧克力醫(yī)生”突然在新加坡出現(xiàn)。不管什么樣的手術(shù)，不管患者是誰，“巧克力醫(yī)生”都會成功。但是，請“巧克力醫(yī)生”主刀的條件有三：一億日元現(xiàn)金、在保密合約上簽字，以及準備應(yīng)援巧克力。誰都不知道這位醫(yī)生的真實身份，傳說“巧克力醫(yī)生”的右手是假肢。野田哲也(坂口健太郎 飾)與年齡小到足做他女兒的寺島唯(白山乃愛 飾)坐飛機從新加坡回日本。在飛機，他們遇到麻煩。機長突然昏迷，機組呼叫醫(yī)生。野田覺得機上或者有別的醫(yī)生，就想假裝睡著了，但在小唯催促下，他不得不離開座位。同機的東京新聞記者奧泉看到野田走向機長室，覺得他的右手有點怪。野田把右手放在口袋里，奧泉渚(西野七瀨 飾)懷疑他的手是假肢。因為這次意料外的相遇讓本來一直在調(diào)查巧克力醫(yī)生卻始終沒有頭緒的奧田，情緒一下高漲起來。野田進入機長室，發(fā)現(xiàn)機倒在副機長旁邊。馬上檢查機長瞳孔和脈搏的人竟不是野田，而是跟在他后面進來的小唯。副機長慌了，但小唯說別把她當小孩，年齡只是數(shù)字而已。她用手邊的工具進行了完美的處置，救了機長一命。其實，她就是“巧克力醫(yī)生”。這位只有10歲的天才少女為了某個原因回到日本?；貒?，“巧克力醫(yī)生”的代理人“Teacher”就接受了委托。委托人是議員秘書登戶龍彥。患者是龍彥的父親、準備出馬參與執(zhí)政黨總裁選舉的眾議員議員登戶龍男。野田接受了委托，以高客報酬為餌，請到了“鰻魚”“余額”“QB”“洗腳水”“搞笑藝人”和出川(古川雄大 飾)，六位水平極高的醫(yī)務(wù)人員?！癟eacher”主持下的最強醫(yī)療團隊集結(jié)完畢。為了揭開兩年前事件的真相，Teacher和“巧克力醫(yī)生”的手術(shù)開始了。